Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO48Q5FWF7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms