Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC92Q53HC0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms