Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms