Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms