Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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