Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms