Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACKR1Q16570 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms