Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD2Q16342 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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