Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms