Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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