Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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