Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SS18Q15532 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms