Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms