Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA4Q13439 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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