Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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