Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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