Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANK3Q12955 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANK3Q12955 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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