Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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