Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD300CQ08708 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms