Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms