Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms