Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN1Q05586 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms