Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHDQ02161 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms