Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
IFITM3Q01628 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms