Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms