Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIRAP54198 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIRAP54198 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms