Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA4P51532 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms