Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB5CP51148 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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