Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD2P49005 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD2P49005 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD2P49005 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD2P49005 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms