Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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