Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms