Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms