Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN1P21941 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN1P21941 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms