Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMD1P17707 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AMD1P17707 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMD1P17707 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms