Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ESRRAP11474 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms