Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMIGD3P0DMS9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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