Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC2O95409 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms