Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN11O75508 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms