Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCN2BO60939 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms