Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSVO60911 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms