Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms