Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AURKAO14965 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms