Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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