Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IDSB3KWA1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms