Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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