Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms