Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms