Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMBRD1Q9NUN5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms