Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms