Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms